AG Jiménez-Soto

Molekulare Toxikologie | Leitung: PD Dr. Luisa F. Jiménez-Soto

Leitung

PD Dr. rer. hum. biol. Luisa Jiménez-Soto

Forschung

Haben Sie sich jemals gefragt, welche Geheimnisse in bakteriellen Toxinen verborgen sind? Diese Proteine, die von Bakterien eingesetzt werden, lösen faszinierende Veränderungen in verschiedenen Organismen aus. In unserem Labor tauchen wir tief in diese komplizierte Welt ein und nutzen die Möglichkeiten des maschinellen Lernens und der Bioinformatik, um die Geheimnisse bakterieller Toxine und ihre Auswirkungen auf bestimmte Raubtiere wie Ciliaten und Amöben zu entschlüsseln.

Was wäre, wenn wir entschlüsseln könnten, wie diese natürlichen bakteriellen Räuber die Toxine bekämpfen? Stellen Sie sich vor, was das für die Stärkung der Abwehrkräfte unserer eigenen Immunzellen gegen diese Bedrohungen bedeuten würde!

Unser Engagement geht über die Entdeckung hinaus; wir setzen uns aktiv für die Grundsätze von Open Science und FAIR-Daten ein. Begleiten Sie uns auf unserem Weg, die Reproduzierbarkeit der Forschung zu verbessern und offene Diskussionen über die Funktionsweise bakterieller Toxine zu fördern. Sind Sie neugierig? Tauchen Sie ein in unsere Erkundungen auf unserem YouTube-Kanal, wo wir Open Science aus erster Hand erleben.

Wir rufen alle Wissenschaftsenthusiasten - Studenten, Doktoranden, Postdocs und leitende Forscher - auf, sich der Bewegung für offene Wissenschaft anzuschließen. Lassen Sie uns Erfahrungen und Erkenntnisse austauschen, um die Forschungspraxis zu verändern. Ich bin gerne bereit, meine Erfahrungen mit Ihnen zu teilen, also melden Sie sich, wenn Sie interessiert sind.

Die Bildung steht im Mittelpunkt unseres Auftrags. Wir glauben an die Förderung der nächsten Generation, um sie zu befähigen, die Zukunft der Forschung zu gestalten. Um Gaststudenten zu unterstützen und den Horizont unserer Forschung zu erweitern, haben wir die Stiftung Exotoxins Lab gegründet. Möchten Sie einen Beitrag zu unserer Sache leisten?

Hier erfahren Sie, wie Sie uns unterstützen können:

1. Beteiligen Sie sich an unserer YouTube-Community - abonnieren, liken und kommentieren Sie unsere Videos.
2. Ziehen Sie eine steuerlich absetzbare Spende in Betracht, um unsere Forschung zu unterstützen. Sie können hier spenden.

Lassen Sie uns gemeinsam das Potenzial bakterieller Toxine erschließen, das Lernen fördern und eine kollaborative Zukunft für die wissenschaftliche Erforschung gestalten!

Kooperationen, Projekte, Mitgliedschaften und Funktionen

Forschungsgruppe von Prof. Burkhard Rost (TUM - München, Deutschland)

Prof. Rost und sein Team stehen hinter unserer Ausbildung in den besten Methoden des maschinellen Lernens.
Mit ihrer Hilfe nutzen wir die Vorteile beider Welten: Bioinformatik und Molekularbiologie, um neue Aspekte von Toxinen zu entdecken.
Sie können mehr über ihre Forschung erfahren hier

Forschungsgruppe von Dr. Carlos Alberto Calderon (Universidad del Rosario, Bogotá, Kolumbien)

Dr. Carlos Alberto Calderon ist ein Experte für Pharmakovigilanz aus Kolumbien.
Gemeinsam verwenden wir Large-Language-Modelle, um mehr über die in medizinischen Behandlungen verwendeten Toxine herauszufinden. Mehr über sein Team finden Sie hier

SSTDBB: Sprechen Sie Toxin? Die Botschaft der Bakteriophagen.

Dies ist ein Projekt, das mit der Unterstützung des BMBF zählt. Der Hauptzweck der Ausschreibung, in der dieses Projekt angenommen wurde, ist es, Methoden des maschinellen Lernens in Bereiche der Wissenschaft zu bringen, in denen sie noch nicht häufig eingesetzt werden.
Die deutsche Beschreibung finden Sie unter https://www.bildung-forschung.digital/digitalezukunft/de/wissen/Datenkompetenzen/datenkompetenzen_wissenschaftlichen_nachwuchs/Projekte/sstdbb.html?nn=729750

Wir freuen uns, dass wir zu den folgenden Organisationen beitragen und dort aktive Mitglieder sind:

OSIM - Initiative für offene Wissenschaft in der Medizin

Unsere medizinische Fakultät ist sich der Bedeutung von Open Science für den Fortschritt medizinischer Behandlungen und der Notwendigkeit reproduzierbarer und replizierbarer Forschung bewusst. Wir treffen uns monatlich und heißen von Bachelor-Studenten bis zu PIs alle willkommen, die sich an den Diskussionen und Schulungen beteiligen möchten, die wir vorbereiten, um die Theorie der offenen Wissenschaft in die Praxis zu bringen.
Weitere Informationen und geplante Veranstaltungen finden Sie unter here

OSC - Open Science Center der LMU - München

Das Open Science Center ist die Organisation, die unter der Leitung von Felix Schönbrodt (Psychologie) die Open Science an die LMU gebracht hat.
Mehr Informationen zu Veranstaltungen und Aktivitäten finden Sie unter here

LMU Lateinamerika-Netzwerk

Dies ist ein Netzwerk von Wissenschaftlern an der LMU, aus allen Disziplinen, mit dem Ziel, Verbindungen zu Lateinamerika aufzubauen und zu verstärken. Mehr dazu finden Sie here

DGHM - Deutsche Gesselschaft für Hygiene und Mikrobiologie

Die Deutsche Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie (DGHM) e. V. hat die Förderung des wissenschaftlichen Austausches auf den verschiedenen Teilgebieten der Medizinischen und Molekularen Mikrobiologie, Infektionsimmunologie sowie der Hygiene und des allgemeinen Gesundheitswesens als erklärtes Ziel. Mehr Informationen gibt es hier

The Carpentries

Die Carpentries fördern weltweit grundlegende Fähigkeiten in den Bereichen Datenverarbeitung und computergestützte Methoden, um effiziente, offene und reproduzierbare Forschung zu ermöglichen. Sie schulen und unterstützen eine aktive, inklusive und diverse Gemeinschaft von Lernenden und Lehrenden, die die Bedeutung von Software und Daten in der Forschung fördert und vorlebt. Gemeinsam entwickeln Sie frei zugängliche Lehrmaterialien und vermitteln diese mit evidenzbasierten Lehrmethoden. Der Fokus liegt auf Menschen, die Forschung betreiben und unterstützen. Mehr Informationen gibt es hier

Leitung der AG Jiménez-Soto

Luisa Jimenez Soto
PD Dr. rer. hum. biol. Luisa Jiménez-Soto

AG-Leitung

Publikationen

Unsere Publikationen finden Sie unter PubMed oder ORCID.

Wir planen die Protokolle, die wir im Labor verwenden, zu veröffentlichen. Einige sind bereits unter Protocols.io verfügbar.

Onlinepräsenz

Erfahrungen mit Open Science im Labor möchten wir in unserem Exotoxine Laborkanal veröffentlichen.

ResearchGate nutzen wir, um anderen Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern sowie Studierenden bei ihren Herausforderungen im Labor zu helfen.

Zudem verfügen wir über ein github repository.

Freie Stellen in unserem Labor werden in LinkedIn veröffentlicht

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