Zirkadiane Uhren
Zirkadiane Uhren sind zellendogene und selbstnachhaltige Oszillatoren, die praktisch in jeder Zelle des Körpers zu finden sind und eine grundlegende Rolle in der zellulären und Gewebe-Physiologie spielen. Dieses interne Zeitmesssystem ermöglicht es unseren Organen, sich molekular auf wiederkehrende Bedürfnisse im Laufe des Tages einzustellen und ihren Stoffwechsel auf die sich verändernde Umwelt vorzubereiten. Während die zirkadiane Uhr Stoffwechselprozesse reguliert, rückkoppele die Stoffwechselphasen wiederum auf die zirkadiane Uhr und modulieren deren Aktivität. Wir untersuchen diesen molekularen Austausch, im Zellkern und Chromatin, von Stoffwechselgeweben bei Säugetieren unter Verwendung von Interaktions- und räumlicher Proteomik sowie Phosphoproteomik. Hamzeiy H, Ferretti D, Robles MS*, und Cox J*. (2022) Perseus-Plugin 'Metis' für metabolische pathways-zentrierte quantitative Multi-Omics-Datenanalyse zur Unterstützung statischer und Zeitreihen-Experimentdesigns. Cell Reports Methods. doi.org/10.1016/j.crmeth.2022.100198. *Mitautoren entsprechend. Hansen FM, Tanzer MC, Brüning F, Bludau I, Stafford C, Schulman BA, Robles MS*, Karayel O*, Mann M*. (2021) Datenerfassungsmethode ohne Datenabhängigkeit zur Analyse des Ubiquitinoms zeigt Regulation der zirkadianen Biologie. Nat Commun. doi: 10.1038/s41467-020-20509-1. *Mitautoren entsprechend. Brüning F, Humphrey SJ, Robles MS (2020) Phosphoproteom- und Proteom-Probenpräparation aus Mausgeweben für zirkadiane Analysen. Methods Mol Biol. doi: 10.1007/978-1-0716-0381-9_14.